พิพิธภัณฑ์ศิลปะผู่ตงตั้งอยู่ในเขตศูนย์กลางทางการค้าและการเงินลู่เจียจุ่ย ทางทิศเหนือติดกับศูนย์การประชุมนานาชาติเซี่ยงไฮ้ ติดกับทิศตะวันตกของแม่น้ำหวงผู่เจียง มีสิ่งก่อสร้างครอบคุลมพื้นที่ ราว 13,000 ตารางเมตร วัสดุหลักที่ใช้ในการก่อสร้างส่วนหน้าของอาคารและพื้นดินเป็นหินแกรนิตสีขาวจากมณฑลซานตง ทำให้ตัวอาคารและภูมิทัศน์โดยรอบๆให้ความรู้สึกเป็นอันหนึ่งอันเดียว

พิพิธภัณฑ์ศิลปะผู่ตงยังมีห้องจัดนิทรรศการพิเศษอีกหลายห้อง ห้องโถงนิทรรศการกลางตั้งอยู่ในพื้นที่ส่วนกลางของตัวพิพิธภัณฑ์ ผ่านจากชั้นใต้ดินไปยังชั้นที่ 4 ที่อยู่เหนือพื้นดิน นอกจากนี้ที่มุมด้านล่างยังมีการติดตั้งลิฟต์ยกเพิ่มอีกด้วย โดยภายในห้องโถงนิทรรศการ "ขนาดใหญ่" ดังกล่าว ผู้ชมจะสามารถชื่นชมและสัมผัสกับประสบการณ์การรับชมผลงานศิลปะได้อย่างใกล้ชิด ซึ่งจะมีการจัดวางผลงานศิลปะไว้ชั้นละ 1 ชิ้น ในมุมมองที่แตกต่างกัน