푸동미술관은 루자주이 금융무역 중심구에 위치해 있으며 북쪽은 상하이 인터내셔널 컨벤션센터와 인접해 있고 서쪽으로는 황푸장 강변까지 이어져 있다. 메인 건축물 부지면적은 약 1.3만m², 건축 외벽과 바닥에 주로 산동 바이마 화강암 재료를 사용하여 주변 풍경과 조화를 이룬다.

푸동미술관에는 특수한 전시홀 몇개가 설치되었다. 중앙전시홀은 미술관 중앙구역에 위치하여 지하 1층부터 지상 4층까지 연결되며 바닥 한쪽에는 승강대가 설치되었다. "거대" 전시홀에서 관중들은 한 예술작품을 서로 다른 층에서 다른 시각으로 관람할 수 있다.